Bis zum 30jährigen Krieg wurden die Toten in Kühnitzsch um die Kirche begraben, welche sich außerhalb des Friedhofes am Schloß befindet.
Wegen Überfüllung durch Pesttote und schwedische Soldaten wurde 1673 von der Rittergutsherrschaft Plötz der Friedhof der politischen Gemeinde Kühnitzsch geschenkt. Es wurde durch die Rittergutsherrschaft eine Ehrbegräbnisstelle errichtet.
Nach 1945 diente sie den Kühnitzschern als Leichenhalle. Die vorhandenen Särge wurden in den Keller eingemauert.

1992 wurde die Friedhofskapelle umfassend renoviert sowie die Umzäunung gefestigt. Neben Urnen- und Erdgräbern gibt es auf dem Kühnitzscher Friedhof auch eine Urnengemeinschaftsanlage (UGA).